Şehit ailelerinin, üst mahkemenin yanı sıra Eskişehir 1. Hava Kuvvet Komutanı Korgeneral Abidin Ünal ve askeri savcıya, sanıkların tutuksuz yargılanması kararına itiraz için müracaatı da kabul edilmedi. Askeri savcılık başvuruyu reddederken komutanlık işleme bile almadı. Mahkeme, suç delillerini karartma, suç vasfının değişebileceği ve kaçma şüpheleri olmadığından, sanıkların tutuklu yargılanmaları talebini reddetti.
Bu karara sert tepki gösteren şehit aileleri, konuyu üst mahkemeye taşıdı. Ailelerin avukatları, Gölcük Donanma Komutanlığı Askeri Mahkemesi'ne dilekçeyle başvurarak, sanıkların görevden alınıp tutuklanmaları talebinde bulundu.

Başvuruda suçun işleniş şekli, şehit sayısının fazlalığı ve 13 milyon lira gibi büyük bir maddi zarar olmasına rağmen sanıkların görev başında bulunması ve tutuksuz yargılanmalarının kamu vicdanını sızlattığı, şehit ailelerinde infiale sebep olduğu vurgulandı.

Ayrıca şehit aileleri, Eskişehir 1. Hava Kuvvet Komutanı Ünal ve askeri savcıya, sanıkların tutuklanma kararına üst mahkemeye itiraz etmeleri için başvurdu ancak hiçbirinden bekledikleri cevabı alamadılar.